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2013年1月18日，在2012年度国家科技奖励大会上，由吴孟超院士、王红阳院士、郭亚军教授领衔的第二军医大学“肝癌临床与基础集成化研究创新团队”因突破肝脏外科多个“禁区”，成为全国3个获国家科技进步奖创新团队奖的团队之一。这是国家科技进步奖中首次设立的奖项。
肝癌因发病率高、恶性程度高被称为“癌中之王”。术后肿瘤极易复发，病人生存期短。目前，我国每年有近40万肝癌新发病例，占全球近50%。
该团队创立与完善了肝癌外科治疗体系，揭示了肝癌发生发展的系列关键新机制，筛选到一批肝癌诊治的新靶点，创建了多项肝癌治疗的新技术。这些技术运用于临床，无数患者的生命得以延续。
这个团队人员年龄跨度大，91岁的吴孟超院士从上世纪50年代起就开展肝癌诊治研究。现在，刚刚跨出校门致力于肝癌研究的“90后”也加入这个创新团队中来。对于这样一个“集团军”，吴孟超院士相当满意，“我们有人琢磨手术技术、有人创新诊疗策略、有人研究发生机理，各显所长。”多年来，该团队曾获国家最高科技奖、科技进步一等奖等；共施行肝胆外科手术5.5万例，5年生存率达到53.2%，培养肝胆专业人才2000余人。
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